仮想COMポートで、通信できないケースはありますか？

仮想COMポートは、F&eITプロトコルと仮想アドレスマップを使用した、Windowsのシリアル通信APIおよびシリアル通信ドライバのエミュレーションになります。
エミュレーションを行っている機能に、若干の制約事項があります。また、ネットワークを使用する為の時間的オーバーヘッドが存在します。、

このため、既存のアプリケーションがそのままでは動作しない可能性があります。

Windows本体シリアルポートのとの互換性、制約事項につきましては、弊社にて認識している限りにおいて、対応しているWin32APIに詳細が記載してありますので、ご確認ください。